Hvor stammer epidemien fra?

I 2002-2003 udbrød en SARS-epidemi i Sydøstasien. Man frygtede, at den ville udvikle sig til en pandemi.

Hvordan sporer man sådan en epidemis oprindelse? Hvordan finder man ud af hvilke vira der udvikler sig til at fremkalde epidemier eller ligefrem pandemier?

Her skal vi prøve hvordan alignment af DNA- eller RNA-sekvenser fra virus kan lede på sporet. 

Det gør du ved først at aligne sekvenser fra forskellige vira. Derefter laver du et fylogenetisk træ.

I temaet anvendes programmet MEGA. Det kan downloades fra: https://www.megasoftware.net/

Der er mange muligheder for at arbejde videre med andre epidemier, også historiske. Der inddrager man aDNA, ancient DNA, dsvs. DNA udvundet fra arkæologisk materiale.

Kilde til forsidebillede: Af Alissa Eckert, MS; Dan Higgins, MAM - This message is number 23312 in the Public Health Image Library (PHIL) of the CDC., Public Domain, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=86444014